黃芩野生于山頂、山坡、林緣、路旁等向陽較干燥的地方，喜溫暖，耐嚴寒，成年植株地下部分在-35℃低溫下仍能安全越冬，35℃高溫不致枯死，但不能經受40℃以上連續高溫天氣。耐旱怕澇，地內積水或雨水過多，生長不良，重者爛根死亡。排水不良的土地不宜種植，土壤以壤土和沙質壤士，酸堿度以中性和微堿性為好，忌連作。

根的生長習性

黃芩為直根系，主根在前三年生長正常，其主根長度、粗度、鮮重和干重均逐年增加，主根中黃芩苷含量較高。第四年以后，生長速度開始變慢，部分主根開始出現枯心，以后逐年加重，八年生的家重黃芩幾乎所有主根及較粗的側根全部枯心，而且黃芩苷的含量也大幅度降低。

莖葉生長習性

黃芩出苗后，主莖逐漸長高，葉數逐漸增加，隨后形成分枝并現蕾、開花、結實,5～6月為莖葉生長期，一年生黃芩主莖約可長出30對葉，其中前五對葉每4～6天長出1對，其后葉片每2～3天長出1對。

開花結果習性

黃芩一年生植株一般出苗后2個月開始現蕾，二年生及其以后的黃芩，多于返青出苗后70～80天開始現蕾，現蕾后10天左右開始開花，40天左右果實開始成熟，如環境條件適宜黃芩開花結實可持續到霜枯期。