該縣出臺養殖場區內污染控制實施方案，劃定了禁養區、限養區和適養區，規定了禁養區的養殖場關停或搬遷時間及措施，治理主體責任區，并將治理方案下達到有關鄉鎮政府；加大巡查督查力度及通報，隨時跟蹤養殖場污染處理動態，杜絕養殖場對污染物不作為；在項目建設扶持內容中，包含有排污設施的建設，如：集糞池、排污溝、污水處理池、化尸池、沼氣池建設等內容。將養殖場污染防治工作放在項目建設的首位，嚴格貫徹“畜禽良種化，養殖設施化，生產規范化，防疫制度化，糞污無害化”的“五化”方案，力求全面開展防污治污工作，全面推進畜牧業從傳統養殖模式轉型升級為“專業化、標準化、規模化”的現代化養殖模式。
同時，對總量減排的養殖場實行一場一檔一冊，要求建立每個養殖場的臺賬及治理運行記錄，實施在線監控和適時巡查；要求每個養殖場建立應急預案，實行一場一案，落實人員負責應急，并定期對養殖污染物應急處置知識進行培訓，提高養殖場處置應急能力；對全縣大中小養殖相關負責人進行防治培訓，落實環保職責，要求養殖怎樣管理、做些什么，提升鄉村環境管理能力，建立完善環保檔案，重視污染源監控、報告和處理，重視環保項目的實施和管理，實現建水縣畜禽污染防治工作全覆蓋。
目前，全縣級畜牧龍頭企業11戶、州級畜牧龍頭企業2戶、各類養殖專業戶1945戶，均與建水縣畜牧獸醫部門簽訂了畜禽污染防治責任書，保證按要求開展污物處理工作。其中，創建的國家級標準化畜禽示范場、省級標準化畜禽示范場、省級現代畜牧養殖示范園區內的規模養殖戶更是起到了示范帶動作用、帶動周邊散養戶進行同時治理，推動了畜牧業污染物防治轉型升級步伐。
