羊肚菌一般生長于松屬、榜屬、櫟屬等樹林下，尤喜生長于舊蘋果園中，蘋果樹的灰分和焦木塊是羊肚菌的養分，可在泡桐苗圃、梨樹園、竹園以及白楊、烏桕、楊樹、柳樹、胡桃、薔薇科、殼斗科等闊葉林下發生，也可在云杉、冷杉針葉林或針闊混交林，甚至玉米地、灌木叢中出現。
羊肚菌的菌絲體生長階段，土壤含水量在50％左右，濕度較低，形成原基和子實體發育則需要大量水分(80-90毫米的降水量)，特別是2-3月份，月降水40-50毫米，且一次降水5-6毫米，4-5日一次是適于子實體的發育，林間相對濕度也較高，一股在80％-85％。
羊肚菌屬低溫型的菌類，地下菌絲體在早春1-2℃就開始生長，出菇期在3-4月，在10-25℃時，菌絲日長速隨溫度升高而加快，高于28℃菌絲日長速則直線下降，在25℃時菌絲日長速雖快，但菌苔層薄，易老化，20℃左右時，菌絲長速較快，且濃密粗壯，所以羊肚菌菌絲體適生長溫度為17-22℃。
