菠蘿蜜種子是菠蘿蜜的種仁，具有一定的營養價值。其含有較高的淀粉（60% 以上）、蛋白質（12% 以上）、低脂肪（低于 1.5%），還富含膳食纖維、礦物質鉀、植物多酚等營養成分，另外也有研究發現其中含有功能因子 γ- 氨基丁酸，含量高達 413.76mg/100g，具有促進記憶、緩解疲勞等功能。

在食用方面，菠蘿蜜種子可以通過鹽水煮等方式煮熟后食用，口感粉糯，有點像板栗。也有人將其和大米一起煮飯，因為菠蘿蜜種子的賴氨酸含量豐富（高達 1% 以上），而谷物缺乏賴氨酸，二者一起吃可形成營養互補，提高蛋白質的吸收利用率