三七是文山壯族苗族自治州特有的生物資源。通過抓基地發展、項目落地、龍頭企業培育和科技創新，三七產業呈現強勁發展勢頭。2012年，實現總產值100.29億元，實現銷售收入136.65億元;三七標準化種植面積達12.5萬畝，占總面積的78%。從抓好重大項目入手，加快推進省級產業園區及云藥基地——文山三七產業園區建設。全州有12戶以三七為原料的加工企業，生產藥品、保健品、日用化學品、食品4大類85個品種155種規格的三七系列產品，實現工業總產值23.96億元。三七制品已進入全國各城市醫院及藥店銷售，以日本、泰國、越南等為重點的國際市場得到不斷拓展，為云南省中藥材產業的發展樹立了典范。同時，還大力發展重樓、石斛、紅豆杉、銀杏等20多個中藥材品種的種植，在丘北建成全國最大的人工紅豆杉種植基地。
辣椒是文山州特色農產品之一。多年來，文山州致力于推動辣椒產業大發展，初步實現了規?；?、基地化、標準化，成為帶動千家萬戶增收致富的大產業。2012年，全州辣椒種植面積達到145萬畝，實現產值22.4億元。辣椒產業中經認定的州級以上農業產業化龍頭企業有19戶，開發出辣椒系列產品40多個。有辣椒交易市場5個，成為全國極具影響力的辣椒交易、加工集散地之一。丘北辣椒以其優良品質受到國內外消費者的歡迎，產品不僅銷往國內各地，還遠銷美國、日本、韓國等多個國家和地區，近年來每年出口創匯達3000多萬美元。
文山州是“世界優質煙葉黃金產區”之一，是“云南黃金走廊”的生態特色煙區，全州境內有780多萬畝宜煙種植面積。近年來，文山州建設了名揚全省乃至全國的現代煙草農業新煙區。2012年，全州共收購煙葉150萬擔，實現煙農收入16億元，分別增長6.2%和26.1%。
油茶等木本油料產業具有生態效益和經濟效益兼備的優勢。近年來，文山州以云南省加快木本油料產業發展為契機，大力發展以油茶、核桃為重點的木本油料產業，計劃到2015年建成木本油料基地500萬畝。2012年底，已建成油茶基地153萬畝、核桃基地187萬畝;實現年產油茶籽937.5萬公斤、茶油及附屬產品1500噸，年產核桃200萬公斤，總產值近10億元?；孛娣e的擴大，帶動了加工企業的發展，涌現出了云南云嶺茶油有限公司等5戶省級龍頭企業，其中云南云嶺茶油有限公司被國家林業局認定為“全國油茶重點企業”。
