二次調查數據顯示，2009年全省耕地數目比1996年第一次調查時的耕地642.16萬公頃（9632.84萬畝）減少了了17.77萬公頃（266.52萬畝），比基于一次調查逐年變更到2008年的耕地607.21萬公頃（9108.09萬畝）多出17.18萬公頃（257.75萬畝），這主要是由于調查標準，技術方法的改進和農村稅費政策調整等因素影響，使二次調查的數據更加全面、客觀、準確。

從耕地質量看，全省耕地中有旱地473.90萬公頃（7108.57萬畝），占耕地比例高達75.90%，有90.76萬公頃（1361.37萬畝）耕地（含梯田）位于25度以上陡坡。

從人均耕地看，2009年，全省人均耕地較1996年一次調查時的0.159公頃（2.38畝）有所下降，略高于全國人均耕地0.101公頃（1.52畝），但仍明顯低于世界人均耕地0.225公頃（3.38畝）水平。

云南省第二次全國土地調查自2007年7月1日起開展，以2009年12月31為標準時點匯總二次數據調查，全面查清了全省土地利用現狀，掌握了我省各類土地資源家底。

《關于云南省第二次全國土地調查主要數據成果的公報》指出，綜合考慮全省現有耕地數量、質量和人口增長、發展用地需求等因素，我省耕地保護形勢仍十分嚴峻。人均耕地少、耕地質量總體不高、耕地后備資源不足的基本省情沒有改變。同時，建設用地增加雖與經濟社會發展要求相適應，但部分地方建設用地格局失衡、利用粗放、效率不高，建設用地供需矛盾仍突出。因此，必須毫不動搖堅持最嚴格的耕地保護制度和節約用地制度，在嚴格控制增量土地的同時，進一步加大盤活存量土地的力度，大力推進生態文明建設。