經過多年的發展，我州農民專業合作社在農村能人、龍頭企業和基層農技、供銷部門的推動下，形成了多元化發展格式，一批農村致富帶頭人、種養大戶等。利用他們的資金、技術、管理和銷售渠道等優勢，牽頭興辦農民專業合作社，主要采取“合作社加農戶”、“合作社加基地加農戶”等模式運作。勐海縣打洛鎮勐板村委會主任巖溫龍帶領群眾創辦益民農產品專業合作社，從2009年創辦至今，已發展會員280戶，有14萬平米的蛋雞、茶花雞和土雞種雞場及226戶社員養殖戶，現有34個鮮雞蛋批發零售網點，年銷售額達800多萬元。
一批農產品加工、銷售等龍頭企業也積極帶動，利用他們的生產技術和市場銷售等優勢帶頭組建農民專業合作社，主要實行“公司加合作社加基地加農戶”的產業化經營發展模式。景洪市基諾山鄉亞諾村古樹茶專業合作社采取與易武正山“斗記”茶葉有限公司合作的方式，由合作社負責收購社員的大樹茶并進行加工，公司負責資金、銷售，避免了合作社因茶葉價格波動和滯銷帶來的風險，既解決了資金問題，又保證了社員收入。
基層農業服務組織和供銷社利用其技術、資金、服務、組織管理、信息、營銷網絡等方面的優勢，圍繞農業生產、流通、加工等興辦各類專業合作組織，帶動更多從事生產的農戶聯合起來，促進農業生產經營向貿工農一體化的方向發展。景洪市供銷社創辦大渡崗松山蛋雞養殖專業合作社，投入資金300萬元，養殖蛋雞1.6萬只，年出售鮮雞蛋70萬個，帶動了周邊群眾的養殖積極性，增加了群眾收入。
在大力發展農民專業合作社過程中，我州積極探索合作社的組織制度創新，不斷完善統分結合的雙層經營體制，統一經營得到較大發展，進一步提高了合作社的組織化程度。入社會員的土地承包經營權不變，繼續在原有土地上從事農業生產，合作社為農戶提供生產投入品、農業技術推廣、田間管理以及產品銷售等服務。磨憨興農蔬菜專業合作社在農戶土地承包經營權不變的前提下，采取訂單式生產，由合作社統一發放種子、統一供應生產資料、統一技術指導、統一質量標準、統一銷售服務，自2008年成立以來，累計為當地農戶增收5000余萬元，解決了社員在種子、繁育、移栽、管理、銷售等環節的難題，為社員提供“一條龍”式的統一經營服務。
同時，我州在發展壯大農民專業合作社過程中，不斷創新經營模式，實現了農業經營方式的加快轉變。一些合作社自辦加工和流通實體，進一步延伸了產業鏈。勐臘縣瑤區冬瓜豬養殖專業合作社不僅養殖冬瓜豬，還將冬瓜豬肉加工成豬油、臘肉、香腸、豬肉干、罐頭等“滇瑤”牌系列食品，深受歡迎；一些合作社由于受資金、技術、管理、市場等因素的影響，創辦的實體往往規模不大，帶動能力不強。為了發展壯大，合作社積極探索與龍頭企業進行合作，實行“龍頭企業”加合作社（加基地）加農戶的經營模式，帶領農民闖市場。勐臘縣興邦生豬飼養專業合作社與國家級高新技術企業、農業產業化國家重點龍頭企業大北農集團合作，在勐臘縣成立大北農養豬服務中心，向社員提供飼料、技術、信息、獸藥等服務，增強了合作社的競爭實力；一些合作社在發展過程中積極探索“農超對接”模式，與大型超市合作，減少了農產品流通環節，降低了流通成本。景洪市大渡崗鄉大沙壩水產品養殖專業合作社養殖的“羅氏沼蝦”，直接進入了大潤發超市，解決了社員賣魚難的問題。
