據了解，王守業的違法亂紀行為，主要發生在1995年至2001年，其執掌總后基建營房部大權期間。該部門主要負責軍隊的營房、港口、機關等基礎設施建設，實際財權很大。王守業的一位下屬甚至聽到他抱怨，調任海軍副司令員后，自己的實權似乎不如以前。

在總后期間，王守業全面負責全軍第三代營房的改造工作。同一時期，以建立住房補貼制度為核心的軍隊房改工程也啟動，住房分配貨幣化開始實行。

王守業曾在接受《解放軍報》采訪時稱，如果全軍在1999年全部兌現住房補貼，一次性動用資金就達數百億元。據了解，該補貼覆蓋了全軍70%以上的人員和90%的地區。另有媒體分析：“對軍隊將士發放住房補貼款比較直觀，從中撈好處的可能性小些。相比之下，由于軍隊房改需要，大量軍隊用房不斷上馬，比如，設于各省城繁華地帶的軍隊駐地，有相當比例選擇對原有土地進行置換，并擇地新建營房。由此形成的市場交易資金數以億元計。”

龐大的資金量、部隊嶄新的用房改革政策，讓王守業有空子可鉆。加上“部隊的招投標較其他公用建筑的招投標制度相對寬松，有時會以涉及軍隊機密或軍備等原因，采取邀請招標或議標的方式進行，在很大程度上，仍采取由領導說了算的發包方式”。大權獨攬的王守業更是對簽字環節特別在意，除了自己，誰說話都不能算數。如此一來，身為總后基建營房部部長，他對巨額資金、資產的調配權變得格外巨大，他本人也成為許多建筑承包商的進攻對象。

由于大權在握，雖然自1995年后不斷有內部人士舉報王守業有經濟問題，但都沒能把他告倒，反而接連升遷。直到最高首長親自過問，他才被送上法律的審判臺。最終，經查實，王守業貪污、挪用的款項達1.6億元之巨。

金錢之外，新華社報道中的“道德敗壞”4個字，則將問題指向了王守業包養多名情婦的事實。有軍方紀委人士稱，王守業所涉經濟問題源于內部舉報。其實，這個所謂的內部，除了之前的大量信件舉報外，主要是他的情婦蔣某等人的直接上訪舉報。而這，也許是王守業與情婦盡享魚水之歡時萬萬沒有料到的。

十多年前，在坐擁了金錢、權勢之后，王守業便包養了多名情婦，其中相對固定、時間最長的，是原某軍區文工團演員蔣某。王守業相中蔣某后，憑著自己的權勢地位，輕易將她調至北京，包養起來，二人過起地下夫妻的生活。

蔣某曾為王守業生下一個兒子，并一度以為兩人會有一個結果。可2001年，王守業在晉升為海軍副司令員后，卻對蔣某提出的結婚要求置若罔聞。無奈之下，蔣某只得選擇放棄這段關系，提出分手。她同意將兒子的監護權交給王守業，但條件是，王必須給她500萬元作為青春損失費。為了這筆數額龐大的“青春損失費”，兩人討價還價好幾年，卻始終不能達成一致。蔣某這才心灰意冷，決定向中央軍委領導舉報王守業的丑行。兩人隱藏多年的私情終于暴露了。

2005年12月23日，王守業被中央軍委紀律檢查委員會“雙規”。次年5月，軍委檢察部門介入對此案的調查。王守業的幾名情婦都在被查之列，蔣某更因涉案最深受到嚴密調查。此外，與此案有牽連的4名少將、7名大校中，5名被責令退伍，6名被降級。

最終，王守業被判處無期徒刑，成為新中國成立以來被查辦的最高級別的軍官之一。本應在2006年6月正常卸任的他，最終未能等到這一天。